L’utilisation des outils de génétique des populations pour répondre à des questions concrètes de gestion piscicole et halieutique et pour améliorer les diagnostics de fonctionnalité des populations naturelles est l’une des activités fondatrices de SCIMABIO Interface. Les technologies de biologie moléculaire et les capacités de traitements informatiques et statistiques sont en constantes évolutions ce qui permet de pouvoir proposer régulièrement de nouvelles applications opérationnelles. Par exemple, les outils génétiques permettent de renseigner sur la « naturalité » des populations et d’évaluer l’empreinte génétique laissée par les repeuplements historiques, d’estimer les taux d’efficacité des pratiques de repeuplement en cours, de caractériser la structuration génétique des populations pour mettre en évidence les effet de la fragmentation des habitats et les gains associés aux travaux de restauration de la continuité écologique et de suivre de nouveaux indicateurs de fonctionnalité comme le nombre de géniteurs efficaces.